События ленты разворачиваются спустя год после масштабного противостояния Годзиллы и боевого робота Мехагодзиллы, созданного японскими военными для защиты мегаполиса от древнего чудовища. Жители Токио наконец возвращаются к обычной жизни после разрушений, пока не получают странное предупреждение от представителя другого легендарного монстра — Мотры, покровительницы человечества и заклятого...
