Реальная история исчезновения первой британской колонии на территории Америки, основанной на острове Роанок в 1587 году, остается одной из самых загадочных тайн Нового времени. Фильм «Затерянная колония» предлагает свою версию событий, разворачивающихся после того, как 117 переселенцев высадились на берег Вирджинии и начали строить поселение, не подозревая, что их ждет.
Действие фильма разворачивается в датской провинции середины 1990-х, где 15-летний старшеклассник Стиг переживает привычные для подростка его возраста метаморфозы: он задумывается о своём месте в мире, сталкивается с первыми взрослыми проблемами и неожиданно понимает, что влюблён в свою новую учительницу Виолу.