Заброшенная церковь на окраине небольшого испанского городка хранит мрачную тайну, которую местные жители передают из поколения в поколение в виде пугающих легенд о пропавших детях, заточенных внутри её стен. Для одиннадцатилетней Эммы эти истории перестают быть просто сказками, когда её начинают преследовать призраки маленьких исчезнувших жителей городка, а обычная жизнь рушится в одночасье.
Действие фильма разворачивается в Испании 1876 года, в разгар военных столкновений, которые уносят countless жизней, в том числе и родителей маленькой Амайи. Во время одного из рейдов по разоренным поселениям девочку находит загадочная женщина, которая вытаскивает её из-под обломков разрушенного дома, укрывает от солдат и забирает с собой, спасая от неминуемой гибели.
Действие разворачивается в небольшой рыбацкой деревушке на севере Испании, где жизнь кипит по своим, веками сложившимся правилам, а посторонним не рады. Инспектор Нерея Гарсия получает неожиданное назначение: ей предстоит выяснить судьбу Хосу, капитана местного судна и зятя одного из самых влиятельных бизнесменов соседнего города, который бесследно исчез после очередного рейса.