Действие фильма разворачивается в постапокалиптическом мире, где выброс токсина, уничтожающего человеческую память, почти полностью стер цивилизацию, как мы её знаем. Пять членов одной семьи нашли спасение в закрытой оранжерее, которая не только защищает их от отравленной атмосферы, но и поддерживает самодостаточный цикл очистки воздуха, позволяя выживать в полной изоляции от внешнего мира.
Милдред Хаббл попадает в старинную британскую волшебную академию Кэклс, где ученики учатся варить зелья, управлять метлами и разгадывать тайны магического мира. Но вместо блестящих успехов она постоянно попадает в нелепые ситуации: сбивает заклинания, перепутывает ингредиенты для зелий, случайно вызывает хаос на уроках, из-за чего окружающие дают ей обидное прозвище «Самая плохая ведьма».