Действие фильма разворачивается в 2021 году, когда мир уже пять лет живет с последствиями таинственного вируса, превратившего часть населения в кровожадную нежить. Для сдерживания распространения заразы и поиска способа ее победить власти создали специальный Отдел по Борьбе с Заразой, в который отбирали самых подготовленных солдат и специалистов по работе с инфицированными.
Команда Скуби-Ду отправляется в теплое путешествие на Гавайи, где на острове Большая Кахуна проходят ежегодные соревнования по серфингу Ханахуна. Шегги, Скуби-Ду, Дафна, Фред и Велма приезжают не только чтобы поддержать участников и насладиться пляжным отдыхом, но и разобраться в странных событиях, которые начинают происходить незадолго до начала турнира.